かつては静かな連邦の植民地であったBoaco６は、今革命の真っ直中にあった。〈エンタープライズ〉の使命はその惑星との接触を再開し、連邦とBoaco６との間の公的関係を強化すべきか否かを見極めることであった。
　カーク艦長と惑星を支配する若者議会との間の協議は順調に進んだが、突然、宇宙連邦軍の実験船によってBoacanの船が破壊され、友好的な雰囲気は霧散してしまう。
　全面戦争が勃発するのを防ぐために、〈エンタープライズ〉は盗まれた宇宙連邦軍の船と誘拐犯を捕まえなくてはならない。そのためには銀河系の最大の隠遁者で天才の助けを必要とした。そして、カークは彼の過去の長く葬られていた秘密と向き合わなくてはならなくなる。

by　（智）